env들을 anaconda에 올려두고 그때그때 가져다 쓰면 편할 듯 하다.
Quickstart
anaconda-client 가 필요하다.
mamba install anaconda-client -n base
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enrivonment YAML 파일 Upload 하기
anaconda upload [ENVIRONMENT].yaml
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Upload 된 환경 이용해서 설치하기
conda env create dohlee/[ENVIRONMENT]
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Template
name: my-env
channels:
- conda-forge
- bioconda
- defaults
dependencies:
- bismark=0.22.3
- methyldackel=0.4.0
- trim-galore=0.6.6
- sambamba=0.6.8
YAML
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