Search
Duplicate
⬆️

SRA 데이터 업로드 방법

1.
SRA Submission Portal Wizard 에 로그인한다.
나는 ORCID로 로그인함.
2.
New SRA submission을 생성한다. “New submission” 버튼을 누르면 됨
3.
Submitter 정보를 입력한다.
a.
Submitter는 내 정보, Submitting organization은 서울대학교 암연구소로 함.
4.
General information을 입력한다.
a.
기존 BioProject, BioSample이 있는지 물어보는데, 없으니까 No
b.
Release date는 내가 정한 날짜 or Publication date 둘 중 빠른 것으로 정해진다. Publication 시에 공개하고 싶으면 release date를 최대한 늦게 설정하자.
5.
Biosample Type을 입력한다.
a.
human을 선택. 이러면 다음 Biosample Attribute 입력 시에 human에 해당하는 table이 나오게 된다.
6.
Biosample Attribute을 입력한다.
Human.1.0.xlsx
11.0KB
Human 1.0 위의 테이블 채우면 된다. 초록색 field만 mandatory
7.
SRA metadata를 입력한다.
a.
8.
File upload
~/.aspera/connect/bin/ascp -i aspera.openssh -QT -l100m -k1 -d data_upload subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:uploads/dohlee.bioinfo_gmail.com_yMBDcHcA
Shell
복사